Добро пожаловать на сайт <БагБД>, где вы можете задавать вопросы о программировании и разработке на Битрикс и Битрикс24, и получать быстрые и квалифицированные ответы от профессионалов!
Если я Вас правильно понял. В фильтре есть следующие свойства -
SECTION_ID - по родительской группе. Если значение фильтра false, "" или 0, то будут выбраны элементы не привязанные ни к каким разделам. Иначе будут выбраны элементы привязанные к заданному разделу. Значением фильтра может быть и массив. В этом случае будут выбраны элементы привязанные хотя бы к одному из разделов указанных в фильтре. Возможно указание отрицания "!". В этом случае условие будет инвертировано;
SECTION_CODE - по мнемоническому коду родительской группы. Аналогично SECTION_ID;
Добавляете их или одно из них в массив $arFilter в вашем примере по аналогии с IBLOCK_ID (в дополнение к нему) и ага. В документации лучше описано.