Добро пожаловать на сайт <БагБД>, где вы можете задавать вопросы о программировании и разработке на Битрикс и Битрикс24, и получать быстрые и квалифицированные ответы от профессионалов!
Похоже на то, что товар кладётся в корзину дважды. Один раз в количестве 1 единицы товара битриксом и второй раз -- в количестве $quant вашими исправлениями. Извините, мне отсюда не видно, как именно добавляется товар в корзину, поэтому могу ошибаться.