Добро пожаловать на сайт <БагБД>, где вы можете задавать вопросы о программировании и разработке на Битрикс и Битрикс24, и получать быстрые и квалифицированные ответы от профессионалов!
В шаблоне вложенные уровни просто скрыты стилем display:none,
Вам нужно модифицировать шаблон, добавив условие не для DEPTH_LEVEL > 1, а для DEPTH_LEVEL > 2, тогда у вас будут скрываться не со 2го уровня, а с 3его.